Osim područnih društava unutar Hrvatskoga društva kemijskih inženjera i tehnologa djeluju i Sekcije koje okupljaju inženjere i kemičare koje se zanimaju za posebna područja, a koji onda djeluju u sklopu plana i programa rada HDKI-a.
Trenutno djeluju sljedeće Sekcije:
Sekcija za kemijsko inženjerstvo
Predsjednik: prof. dr. sc. Ante Jukić (01/4597–128)
Sekcija za kromatografiju
Predsjednik: prof. dr. sc.Tomislav Bolanča (01/4597–209)
Sekcija za nomenklaturu organske kemije
Predsjednica: prof. dr. sc. Lidija Varga Defterdarović (01/3733–982)
Sekcija za ekološko inženjerstvo
Predsjednica: prof. dr. sc. Felicita Briški (01/4597–269)
Sekcija za makromolekule
Predsjednica: prof. dr. sc. Sanja Lučić Blagojević (01/4597–190)
Sekcija za elektrokemiju i elektrokemijsko inženjerstvo
Predsjednica: dr. sc. Višnja Horvat Radošević, (01/4561–152)
Sekcija za obrazovanje
Predsjednik: prof. dr. sc. Ivica Štern
